從背甲和尾長來分別小鱷龜和雜佛鱷龜。
背甲:小鱷龜背甲比雜佛鱷龜背甲長;小鱷龜背甲像半球形的屋頂,有些微小的鋸齒狀,而雜佛鱷龜背甲長寬相近;小鱷龜背甲顏色自暗橄欖綠到棕色都有,雜佛鱷龜背甲長為棕褐色。
尾長:小鱷龜尾巴比雜佛鱷龜長,雜佛鱷龜尾部有環狀鱗片,小鱷龜尾巴沒有環狀鱗片。
背甲:小鱷龜背甲比雜佛鱷龜背甲長;小鱷龜背甲像半球形的屋頂,有些微小的鋸齒狀,而雜佛鱷龜背甲長寬相近;小鱷龜背甲顏色自暗橄欖綠到棕色都有,雜佛鱷龜背甲長為棕褐色。
尾長:小鱷龜尾巴比雜佛鱷龜長,雜佛鱷龜尾部有環狀鱗片,小鱷龜尾巴沒有環狀鱗片。