腹瀉性腸胃炎關鍵是由病毒、細菌、寄生蟲等感染所惹起的，治療關鍵包括調整飲食、藥物治療、補液等。
調整飲食
急性腹瀉期可短期禁食或給予平淡流質飲食，以減輕腸道擔負，但不建議禁食過久，以免惹起營養不良。恢復期可進食平淡、易消化、少渣的食物，防止進食辛辣撫慰性、平淡、生冷食物。
藥物治療
依據病原體選擇相應的藥物啟動治療，如細菌感染惹起的腹瀉性腸胃炎可給予抗生素治療，如環丙沙星、左氧氟沙星、阿奇黴素等；病毒感染惹起的腹瀉性腸胃炎普通不要求抗病毒治療，可給予雙歧桿菌、乳酸桿菌等微生態製劑調理腸道菌群。腹痛嚴重者可給予山莨菪鹼、顛茄等藥物緩解症狀。
補液
腹瀉性腸胃炎患者常會出現水、電解質紊亂，可給予口服補液鹽，以糾正水、電解質紊亂及酸鹼平衡。嚴重者可靜脈補液。
腹瀉性腸胃炎患者應及時就醫，查明病因，在醫生的指點下啟動規範治療，無法自行用藥，以免惹起不良反響。
調整飲食
急性腹瀉期可短期禁食或給予平淡流質飲食，以減輕腸道擔負，但不建議禁食過久，以免惹起營養不良。恢復期可進食平淡、易消化、少渣的食物，防止進食辛辣撫慰性、平淡、生冷食物。
藥物治療
依據病原體選擇相應的藥物啟動治療，如細菌感染惹起的腹瀉性腸胃炎可給予抗生素治療，如環丙沙星、左氧氟沙星、阿奇黴素等；病毒感染惹起的腹瀉性腸胃炎普通不要求抗病毒治療，可給予雙歧桿菌、乳酸桿菌等微生態製劑調理腸道菌群。腹痛嚴重者可給予山莨菪鹼、顛茄等藥物緩解症狀。
補液
腹瀉性腸胃炎患者常會出現水、電解質紊亂，可給予口服補液鹽，以糾正水、電解質紊亂及酸鹼平衡。嚴重者可靜脈補液。
腹瀉性腸胃炎患者應及時就醫，查明病因，在醫生的指點下啟動規範治療，無法自行用藥，以免惹起不良反響。