主要區別有：分布不同、生長習性不同、分類不同。
一、分布不同。
1、蛇果：國內蛇果產地多為山東、陝西，原是美國加州出產的一種蘋果，與蛇一點關係都沒有。
2、蘋果：歐洲、中亞西亞、北美、中國新疆。
二、生長習性不同。
1、蛇果：蛇果產美國，也是美國的主栽品種最適栽培區是美國西部華盛頓州維納奇。那裡的年平均氣溫十點六度，一月份的氣溫為-3℃，夏季為18.3~21.1℃，年降水量為177.8~254.0毫米，但蛇果的年灌水量為1061~1143毫米，所以要有充足的水源在這種氣候下病蟲害發生較輕。
2、蘋果：有較強的極性，通常生長旺盛，樹冠高大，樹高可達15米，栽培條件下一般高3～5米左右。樹幹灰褐色，老皮有不規則的縱裂或片狀剝落，小枝光滑。果實為仁果，顏色及大小因品種而異。
三、分類不同。
1、蛇果：蛇果在洋水果中比較常見，有金蛇果、青蛇果和紅蛇果三種，與蘋果相似，但口感較甜。蛇果含有果糖、葡萄糖、糖、多種維生素、胡蘿蔔素及多種礦物質。最重要的是，蛇果中果膠和鉀的含量居水果類之首。
2、蘋果：蘋果品種數以百計，分為酒用品種、烹調品種、鮮食品種3大類。3類品種的大小、顏色、香味、光滑度（可能還有脆性、風味）等特點均有差別。