手足口並發腦炎首先出現手足口病症狀，繼而出現腦炎症狀：嗜睡、胡言亂語、抽搐等。
手足口病的一般預後良好，但嚴重者可並發病毒性腦膜炎。患兒常先出現手足口病症狀，如：發熱，口腔黏膜、手、足、臀部出現斑丘疹或皰疹，皰疹周圍可有紅暈，皰液較少。若手足口病繼續發展，引起病毒性腦炎，患兒則會出現持續高熱、精神萎靡、嗜睡、噁心嘔吐、進食差、胡言亂語等症狀，較年長患兒可訴頭痛不適。嚴重患兒則出現噴射性嘔吐、昏迷、抽搐、神經源性肺水腫等，遺留神經系統後遺症，患兒易發生呼吸循環衰竭。
手足口病並發腦炎病情較重，需及時送醫，給予脫水降顱壓、抗病毒、激素、丙種球蛋白、營養支持等治療。經及時治療，多數患兒病情可好轉，預後良好。但也有部分患兒因腦實質受累嚴重，預後不良，遺留不同程度神經系統功能損害，如智力異常、運動功能障礙等。
手足口病的一般預後良好，但嚴重者可並發病毒性腦膜炎。患兒常先出現手足口病症狀，如：發熱，口腔黏膜、手、足、臀部出現斑丘疹或皰疹，皰疹周圍可有紅暈，皰液較少。若手足口病繼續發展，引起病毒性腦炎，患兒則會出現持續高熱、精神萎靡、嗜睡、噁心嘔吐、進食差、胡言亂語等症狀，較年長患兒可訴頭痛不適。嚴重患兒則出現噴射性嘔吐、昏迷、抽搐、神經源性肺水腫等，遺留神經系統後遺症，患兒易發生呼吸循環衰竭。
手足口病並發腦炎病情較重，需及時送醫，給予脫水降顱壓、抗病毒、激素、丙種球蛋白、營養支持等治療。經及時治療，多數患兒病情可好轉，預後良好。但也有部分患兒因腦實質受累嚴重，預後不良，遺留不同程度神經系統功能損害，如智力異常、運動功能障礙等。