新中國歷史研究取得了很大進展，主要熱點問題有以下幾個方面：
一、關於中華人民共和國史的學科概念和定位研究
對於深化中華人民共和國史研究問題，學者提出應該在進一步明確國史的學科定位，即明確其獨立的學科地位;進一步拓寬國史的研究視野，即加強對社會生活等薄弱領域的研究;進一步加強國史的學科建設，即健全嚴格的學術規範，綜合運動多學科的研究方法加強國史的學科建設;進一步挖掘國史的檔案文獻，既要加強對檔案文獻的挖掘和利用，又要充分利用已公開的檔案等幾個方面加強和深化國史研究。
在國史研究方法上，有學者提出獨到的見解，認為應將探求歷史發展的規律作為國史研究的使命和目標;從人類歷史發展規律的高度深入研究新中國歷史;以科學發展觀為指導開闢新的研究領域，認識當今人類共同關心的、全球化進程中的熱點問題，並使之成為國史研究的新的增長點。
在當代史研究方面，有學者從當代史與國史、現代史、黨史的關係角度概括了當代史的概念：「中國當代史就是中華人民共和國成立後的中國歷史，是中國近代史的自然延伸;從學科意義上說，它完全是中國現代史，但不完全是國史，不完全是中共黨史」。當代史的主線至少有三條：第一，探索中國自己的建設社會主義道路;第二，爭取早日實現中國的工業化和現代化;第三，維護中國的國家安全、主權獨立和領土完整。
二、關於中國特色社會主義道路研究
中國特色社會主義道路和中國特色社會主義理論體系是國史研究的新課題。學者對中國特色社會主義道路的內涵、理論基礎、指導思想等進行了深入研究，認為：中國特色社會主義道路，就是中國共產黨領導人民自主開拓的、馬克思主義中國化的、引領中國全面發展的、遵循中國社會發展規律和代表人類文明進步方向的社會主義道路，這條道路的開闢具有深厚的理論淵源和思想基礎，科學社會主義的基本原則奠定了理論基礎，毛澤東等探索社會主義建設規律的重要思想和歷史經驗是其思想先導，中國特色社會主義理論體系則是這條道路形成和發展的指導思想。
有學者還深刻闡述了新中國兩個「30年」與中國特色社會主義道路之間的關係，認為新中國頭30年提供的根本政治前提、雄厚的物質基礎、有利的國際條件和正反兩方面教訓，為中國特色社會主義道路提供了必要準備;改革開放後30年實現了對前30年的超越，在基本理論、政治體制、經濟體制和意識形態工作方面不斷完善和發展，兩個「30年」共同促進了中國特色社會主義道路的形成。
還有學者提出，十七大報告對第二次歷史性飛躍的理論成果作了新的表述，將作為對中國特色社會主義道路實踐經驗總結的理論，納入了「中國特色社會主義理論體系」，這是對當代中國馬克思主義創新理論的最新概括。
關於新世紀的城鄉關係研究關於農村人民公社解體的原因成為學者研究的關注點。一些學者從農民主體地位與基層實踐邏輯視角進行考察，認為缺乏經濟基礎與人文支撐的公社制度下的農民沒有發自內心的認同;當廣大鄉村難於落實不合實際的農村政策、特別是基層幹部不能達到政策所要求的現代行政水準時，基層「變通」公社制度也就在所難免，最終導致人民公社制度解體。也有學者從制度績效的角度揭示農村人民公社解體的原因，認為其消極績效明顯，如經濟績效極差，對農村社會經濟乃至整個中國經濟發展起到了某種程度的阻礙作用，也嚴重地影響廣大農民的生活水平和生產積極性，同時助長了工業部門的依賴心理等;農業科技成果的推廣和應用受到多方面限制，其成效並不十分明顯;平均主義的分配方式挫傷農民的積極性。這些消極績效最終導致人民公社解體。
學者還著重於從制度創新視角探討了新世紀城鄉關係問題。有學者認為，無論新中國成立初期城鄉二元結構的形成，還是新世紀構建統籌城鄉發展的新型城鄉關係，制度因素在協調和處理城鄉關係中始終起著關鍵性作用。新世紀在堅持以科學發展觀為指導，以統籌城鄉發展、建設社會主義新農村、建構和諧社會為主要內容的新探索中，城鄉關係構建全面轉向逐步改變城鄉二元經濟結構，促進城鄉經濟社會一體化的制度創新。只有生產力的發展和經濟制度的創新這兩個方面的有機結合，才是改變城鄉二元經濟結構的正確路徑選擇。
三、關於轉變經濟發展方式研究
學者從經濟發展方式和增長方式的對比中，對經濟發展方式的概念進行了界定，認為經濟發展方式不僅包括單純的經濟增長、結構的優化、經濟運行質量和效益的提高，還包括降低消耗、改善資源和生態環境的狀況以及經濟社會自然發展的協調與和諧等各個方面。有學者認為「轉變經濟發展方式，關乎發展理念、發展路徑、發展動力、外部環境調整的系統轉變，是對主要矛盾轉型的主動回應」。針對十七大提出的轉變經濟發展方式的要求，有學者提出應該以人的發展作為轉變經濟發展方式的導向，根據我國改革開放持續推進的經驗，通過政治體制改革掃清經濟發展和經濟體制改革的障礙。
四、關於民生問題研究
黨的十七大提出了「民生」概念，指出要在科學發展觀的指導下，「加快推進以改善民生為重點的社會建設」，這標誌著當代中國以改善民生為重點的社會建設全面展開。學者對民生問題提出的基礎、中國共產黨解決民生問題的經驗、當前民生建設的重點等方面進行了比較集中的研究。有學者提出，改善民生的理論基礎是科學發展觀，改善民生是全面建設小康社會的必然選擇，現階段的主要矛盾是其歷史依據，社會主義初級階段的國情是民生建設的現實要求。有的學者總結新中國成立以來黨解決民生問題的理論與實踐，總結出一些帶有規律性的認識：必須堅持以經濟建設為中心，為改善民生提供強大的物質基礎;解決民生問題要有全面和發展的觀點，堅持把民生與民主、物質與精神、生存與發展問題統籌解決;解決民生問題是一個漸進的歷史過程，必須採取不同的對策和舉措，分階段穩步推進;解決民生問題要尊重人民群眾的主體地位，充分發揮人民群眾的首創精神。
一、關於中華人民共和國史的學科概念和定位研究
對於深化中華人民共和國史研究問題，學者提出應該在進一步明確國史的學科定位，即明確其獨立的學科地位;進一步拓寬國史的研究視野，即加強對社會生活等薄弱領域的研究;進一步加強國史的學科建設，即健全嚴格的學術規範，綜合運動多學科的研究方法加強國史的學科建設;進一步挖掘國史的檔案文獻，既要加強對檔案文獻的挖掘和利用，又要充分利用已公開的檔案等幾個方面加強和深化國史研究。
在國史研究方法上，有學者提出獨到的見解，認為應將探求歷史發展的規律作為國史研究的使命和目標;從人類歷史發展規律的高度深入研究新中國歷史;以科學發展觀為指導開闢新的研究領域，認識當今人類共同關心的、全球化進程中的熱點問題，並使之成為國史研究的新的增長點。
在當代史研究方面，有學者從當代史與國史、現代史、黨史的關係角度概括了當代史的概念：「中國當代史就是中華人民共和國成立後的中國歷史，是中國近代史的自然延伸;從學科意義上說，它完全是中國現代史，但不完全是國史，不完全是中共黨史」。當代史的主線至少有三條：第一，探索中國自己的建設社會主義道路;第二，爭取早日實現中國的工業化和現代化;第三，維護中國的國家安全、主權獨立和領土完整。
二、關於中國特色社會主義道路研究
中國特色社會主義道路和中國特色社會主義理論體系是國史研究的新課題。學者對中國特色社會主義道路的內涵、理論基礎、指導思想等進行了深入研究，認為：中國特色社會主義道路，就是中國共產黨領導人民自主開拓的、馬克思主義中國化的、引領中國全面發展的、遵循中國社會發展規律和代表人類文明進步方向的社會主義道路，這條道路的開闢具有深厚的理論淵源和思想基礎，科學社會主義的基本原則奠定了理論基礎，毛澤東等探索社會主義建設規律的重要思想和歷史經驗是其思想先導，中國特色社會主義理論體系則是這條道路形成和發展的指導思想。
有學者還深刻闡述了新中國兩個「30年」與中國特色社會主義道路之間的關係，認為新中國頭30年提供的根本政治前提、雄厚的物質基礎、有利的國際條件和正反兩方面教訓，為中國特色社會主義道路提供了必要準備;改革開放後30年實現了對前30年的超越，在基本理論、政治體制、經濟體制和意識形態工作方面不斷完善和發展，兩個「30年」共同促進了中國特色社會主義道路的形成。
還有學者提出，十七大報告對第二次歷史性飛躍的理論成果作了新的表述，將作為對中國特色社會主義道路實踐經驗總結的理論，納入了「中國特色社會主義理論體系」，這是對當代中國馬克思主義創新理論的最新概括。
關於新世紀的城鄉關係研究關於農村人民公社解體的原因成為學者研究的關注點。一些學者從農民主體地位與基層實踐邏輯視角進行考察，認為缺乏經濟基礎與人文支撐的公社制度下的農民沒有發自內心的認同;當廣大鄉村難於落實不合實際的農村政策、特別是基層幹部不能達到政策所要求的現代行政水準時，基層「變通」公社制度也就在所難免，最終導致人民公社制度解體。也有學者從制度績效的角度揭示農村人民公社解體的原因，認為其消極績效明顯，如經濟績效極差，對農村社會經濟乃至整個中國經濟發展起到了某種程度的阻礙作用，也嚴重地影響廣大農民的生活水平和生產積極性，同時助長了工業部門的依賴心理等;農業科技成果的推廣和應用受到多方面限制，其成效並不十分明顯;平均主義的分配方式挫傷農民的積極性。這些消極績效最終導致人民公社解體。
學者還著重於從制度創新視角探討了新世紀城鄉關係問題。有學者認為，無論新中國成立初期城鄉二元結構的形成，還是新世紀構建統籌城鄉發展的新型城鄉關係，制度因素在協調和處理城鄉關係中始終起著關鍵性作用。新世紀在堅持以科學發展觀為指導，以統籌城鄉發展、建設社會主義新農村、建構和諧社會為主要內容的新探索中，城鄉關係構建全面轉向逐步改變城鄉二元經濟結構，促進城鄉經濟社會一體化的制度創新。只有生產力的發展和經濟制度的創新這兩個方面的有機結合，才是改變城鄉二元經濟結構的正確路徑選擇。
三、關於轉變經濟發展方式研究
學者從經濟發展方式和增長方式的對比中，對經濟發展方式的概念進行了界定，認為經濟發展方式不僅包括單純的經濟增長、結構的優化、經濟運行質量和效益的提高，還包括降低消耗、改善資源和生態環境的狀況以及經濟社會自然發展的協調與和諧等各個方面。有學者認為「轉變經濟發展方式，關乎發展理念、發展路徑、發展動力、外部環境調整的系統轉變，是對主要矛盾轉型的主動回應」。針對十七大提出的轉變經濟發展方式的要求，有學者提出應該以人的發展作為轉變經濟發展方式的導向，根據我國改革開放持續推進的經驗，通過政治體制改革掃清經濟發展和經濟體制改革的障礙。
四、關於民生問題研究
黨的十七大提出了「民生」概念，指出要在科學發展觀的指導下，「加快推進以改善民生為重點的社會建設」，這標誌著當代中國以改善民生為重點的社會建設全面展開。學者對民生問題提出的基礎、中國共產黨解決民生問題的經驗、當前民生建設的重點等方面進行了比較集中的研究。有學者提出，改善民生的理論基礎是科學發展觀，改善民生是全面建設小康社會的必然選擇，現階段的主要矛盾是其歷史依據，社會主義初級階段的國情是民生建設的現實要求。有的學者總結新中國成立以來黨解決民生問題的理論與實踐，總結出一些帶有規律性的認識：必須堅持以經濟建設為中心，為改善民生提供強大的物質基礎;解決民生問題要有全面和發展的觀點，堅持把民生與民主、物質與精神、生存與發展問題統籌解決;解決民生問題是一個漸進的歷史過程，必須採取不同的對策和舉措，分階段穩步推進;解決民生問題要尊重人民群眾的主體地位，充分發揮人民群眾的首創精神。