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一個是部門，一個是機構。兩者進入資格不同，等級有高低。研究所一詞，來源於近代的科學發展史，在學術界，稱其為科學試驗的研究部門。如地球研究所、物理研究所、天文研究所等等。
擴展資料。
研究所：在學術界，稱其為科學試驗的研究部門。一般讀碩士的`通常是3年，第一年是屬於研究生院集中學習，餘下的2年是在各個研究所繼續深究。
研究院：在學術界，稱其為科學試驗的研究機構。是
大學之後的進階
教育研究機構，一般設於大學中，以「某大學某研究生院」的形式存在，也有獨立設立者。研究生院需大學畢業及同等學歷才能取得報考或申請入學資格，主要為培養碩士、博士人才及進行基礎研究工作，許多大學教授也會在研究生院開課並領導研究工作。