病人有吞咽困難或下咽不暢的症狀，但是不一定都患有食管癌，臨床醫生在診斷時既不能誤診漏掉食管癌病例，也不要草木皆兵，將食管良性疾病誤診為食管癌，造成病人本人和家屬不必要的緊張和恐慌。這裡就涉及食管癌的鑑別診斷問題，需要與食管癌鑑別的疾病有食管本身的疾病，如賁門失弛緩症、反流性食管炎、食管平滑肌瘤、食管憩室、食管異物，此外某些內科疾病，如重症肌無力、硬皮病等也會產生吞咽不暢或吞咽困難。某些先天性異常產生食管外壓性病變，如異常迷走的血管也是少見的吞咽不暢的原因。炎症所致縱隔淋巴結腫大，骨關節退行性病變如頸椎骨刺亦可引起病人的吞咽哽噎感。記住食管癌的典型症狀是進行性吞咽困難這一點非常重要，也是與其他疾病鑑別的要點。另外上消化道鋇餐造影和纖維胃鏡檢查可確切診斷食管癌。
中晚期食管癌內鏡檢查常見到突起、狹窄、潰瘍等，應與一些疾病進行鑑別。除內鏡所見外，x線食管鋇劑造影亦有助於鑑別，結合臨床，一般不難診斷。
中晚期食管癌內鏡檢查常見到突起、狹窄、潰瘍等，應與一些疾病進行鑑別。除內鏡所見外，x線食管鋇劑造影亦有助於鑑別，結合臨床，一般不難診斷。