儒家思想的傳承主要是後人對儒家學說的著作進行了整理和恢復，秦始皇焚書是不完全徹底的。
公元前213年，秦始皇採納李斯的建議，規定除博士官藏書之外，私藏百家之書，除秦國歷史的書籍、醫藥、占卜、種樹的實用、與政治無關的書可以保留，其餘一律焚毀。經過這場大規模的焚書運動，百家書籍幾乎蕩然無存，而僅存於秦朝官方的書籍也在項羽的大火中化作灰燼。這對儒家思想、中國傳統文化的摧殘，都是難以估量的。焚書的第二年，秦始皇在咸陽一次坑殺460多儒生，當時儒生泛指知識分子，包括方士，所以被活埋的不都是儒家學者。秦時，儒學思想已傳播300餘年，儒家思想早已深入人心，根深蒂固。之後，秦朝很快滅亡，漢高祖、漢文帝和景帝實行較寬鬆的政策、百家爭鳴，以及後來漢武帝獨尊儒術，儒學思想迎來了難得的發展機遇。
公元前213年，秦始皇採納李斯的建議，規定除博士官藏書之外，私藏百家之書，除秦國歷史的書籍、醫藥、占卜、種樹的實用、與政治無關的書可以保留，其餘一律焚毀。經過這場大規模的焚書運動，百家書籍幾乎蕩然無存，而僅存於秦朝官方的書籍也在項羽的大火中化作灰燼。這對儒家思想、中國傳統文化的摧殘，都是難以估量的。焚書的第二年，秦始皇在咸陽一次坑殺460多儒生，當時儒生泛指知識分子，包括方士，所以被活埋的不都是儒家學者。秦時，儒學思想已傳播300餘年，儒家思想早已深入人心，根深蒂固。之後，秦朝很快滅亡，漢高祖、漢文帝和景帝實行較寬鬆的政策、百家爭鳴，以及後來漢武帝獨尊儒術，儒學思想迎來了難得的發展機遇。